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2013年5月,知名好莱坞影星安吉丽娜·朱莉自曝已经接受预防性的双侧乳腺切除术,以降低罹癌风险。作为一名珍爱生命并努力为挣钱养家而奋斗的女性,小编也对这些不可控的疾病深感不安。针对那些没有有效******方案的疾病,早期诊断、提前预防是目前******的对抗策略。而这恰恰也是技术的重难点所在,能否快速、******诊断关系到小命的安全。小编怀着惴惴不安的心情与研发部的同事促膝长谈了一番,意外得知***近新推出的第二代针对靶向扩增子建库的试剂盒-VAHTS AmpSeq Library Prep Kit V2,通过几毫升血液建库测序就可获知自己是否是癌症的易感人群,或某些基因变异疾病诊断。不禁感叹现在的分子生物技术的强大,那就跟小编具体了解下这款强大的试剂盒吧。
VAHTSTM AmpSeq Library Prep Kit V2
一管操作,简洁不简单
多类型样本兼容(gDNA, FFPE, cfDNA)
样本量兼容范围广(1-100 ng)
省时,文库生成4小时
引物消化技术,减少数据浪费
>95% on-target比例
双平台兼容(Illumina & Ion Torrent)
宽泛的样本GC兼容性
用 VAHTS TM AmpSeq Cancer HotSpot Panel 为引物,VAHTS TM AmpSeq Library Prep Kit V2 扩增 207 个不同 GC 含量扩增子,绝大多数扩增子测序深度均超过 20% 平均测序深度,显示出卓越的 GC 兼容性。
精准的靶向比对性
vazyme的VAHTS TM AmpSeq Library Prep Kit V2和T公司的多重扩增试剂盒分别以人293T细胞基因组DNA、FFPE样本提取的DNA和cfDNA 为模板,用 VAHTS TM AmpSeq Cancer HotSpot Panel 为引物建库,并分析数据On-target比例。由图可知,无论起始模板是来源于细胞提取的高质量基因组,还是来源于复杂模板如FFPE样本和cfDNA,on-target比例均高于95%,且多次实验结果重复稳定。
卓越的数据均一性
Vazyme的VAHTS TM AmpSeq Library Prep Kit V2配合 VAHTS TM AmpSeq Cancer HotSpot Panel 建库的 207 个扩增子的测序深度进行统计分析,由上图可以看出,测序深度都超过了20% 平均测序深度,且平均深度在 50%的位点比例超过 95%,将207 个扩增子的测序深度按由低到高进行排序,仅少量的几个扩增子低于50% 的平均测序深度,数据表现出卓越的扩增均一性。
产品概述
本试剂盒是基于多重PCR及末端引物消化等技术上,设计研发的一款针对靶向扩增子建库的试剂盒。建库全程在一管内进行,过程简单、快速,从扩增到文库生成,时间低至4 h,可兼容1~100 ng的gDNA、FFPE样本、cfDNA等模板,试剂盒兼容VAHTS TM AmpSeq Cancer HotSpot Panel(Vazyme#NA102)、Ion Ampliseq TM 系列以及个性化定制Panel,同时,配合使用VAHTS TM AmpSeq Adapters for Illumina(Vazyme #NA110系列)或VAHTS TM AmpSeq Adapters for Ion Torrent(Vazyme #NA120系列),可兼容 Illumina或Ion Torrent测序平台。相比于上一代产品(Vazyme # NA101),本试剂盒在保证扩增子文库覆盖度和均一度的基础上,对FFPE、cfDNA等复杂样本兼容性有了极大提高,优化的多重扩增Mix减少了移液操作,建库结果更加稳定、可靠。